Священномученик Вениамин родился в семидесятых годах девятнадцатого века, в Архангельской губернии, в семье священника. Юноша получил духовное образование.
Еще участь в семинарии он активно участвовал в деятельности Общества религиозно-нравственного просвещения», организовывал духовные беседы для рабочих с городских окраин.
В академии он принял монашеский постриг, преподавал в Рижской духовной семинарии. Затем стал епископом Гдовским – викарием (то есть, помощником) Петроградского митрополита, впоследствии заняв главную Петроградскую кафедру.
Все усилия он направлял на поддержку паствы во время сложных испытаний. Любовь верующих к владыке Вениамину была настолько велика, что его называли «наш батюшка Вениамин».
После окончания гражданской войны страну охватили голод. Это послужило причиной новых гонений на Церковь. Власти решили изъять церковные ценности, якобы в пользу голодающих, но на самом деле предполагали использовать их в политических целях, что явствует из переписки высшего руководства большевиков.
Митрополит Вениамин лично благословил передачу церковных ценностей, не имеющих прямого богослужебного предназначения. Но и это было использовано, как обвинение против владыки.
Состоялся суд, на котором митрополит Вениамин и его сподвижники были приговорены к смертной казни. По свидетельствам владыка принял приговор спокойно, сказав, что во всем полагается на Бога.