Будущий подвижник родился в семье бояр Майковых, в тридцатых годах пятнадцатого века. Монашеский постриг принял в обители преподобного Кирилла Белоезерского.
После многолетнего пребывания в монастыре преподобный Нил с одним из учеников отправился в паломничество на Восток. В течение десяти лет преподобный посетил Палестину, Константинополь и гору Афон.
Преподобный Нил желал приобщиться к духовному опыту восточного монашества.
После возвращения в Россию на реке Соре преподобный Нил основал обитель. В основу устройства монастыря были положены древние монашеские традиции и уставы Египта, Афона и Палестины.
От желающего подвизаться в монастыре преподобного Нила требовалось знание Священного Писания и решимость следовать уставам отцов Древней Церкви. «Если есть и воля Божия, чтобы иноки пришли к нам, то подобает им предания святых знать, хранить заповеди Божии и исполнять предания святых отцов». Поэтому в обитель принимались только грамотные монахи, имеющие опыт жизни в других монастырях.
Насельники монастыря пребывали в безмолвии и молитве, занимаясь чтением и переписыванием святоотеческих книг.
Сохранился Устав, составленный преподобным Нилом. Преподобный писал, что желающему спастись, подобает мысленно и чувственно по божественным Писаниям и по житию святых отцов, насколько возможно, поступать».